آیت‌الله ملکوتی با بیان اینکه جمهوری اسلامی از راههایی که عرف دیپلماسی در اختیارش قرار داده باید به این موضوع واکنش نشان دهد، خاطرنشان کرد: می‌توان از طریق مطرح‌کردن این مسئله در سازمانهای بین‌المللی به آن واکنش نشان داد. هرچند ما با دولت کذایی بحرین ارتباطی نداریم اما مسئولین وزارت خارجه می‌توانند کشورهایی را که با هر دو طرف ارتباط دارند در جریان قرار دهند تا به مسئولین بحرین گوشزد کنند که با محاکمه کردن شیخ عیسی، در برابر افکار عمومی مردم و به‌ویژه مسلمانان مسئول‌اند.
عضو مجلس خبرگان رهبری با ابراز "من معتقدم این کار به مرحله محاکمه نمی‌رسد"، متذکر شد: همان‌طور که مقام معظم رهبری صریح و روشنگرانه فرمودند، آیت‌الله شیخ عیسی قاسم صحبتهایش به‌گونه‌ای بود که جلوی تندرویها را در بحرین می‌گرفت و جوانان را کنترل می‌کرد. این بی‌شعوری حاکمان بحرین است که با ایشان این‌گونه برخورد می‌کنند.
وی افزود: اگر حکومت آل‌خلیفه این جسارت را کند و ایشان را محاکمه نماید، پوچ بودن و کم‌عقلی خودشان برای همه دنیا مسلم می‌شود، غیرت مردم به جوش خواهد آمد و انقراض این حکومت پوشالی را سریع‌تر خواهد کرد.
