ابزاری برای آنالیز ساختاری «کمپلکس‌های» پروتئینی

به گزارش خبرگزاری بسیج، بسیاری از ساختارهای پروتئینی از کنار هم قرار گرفتن چندین زنجیره پلی پپتیدی تشکیل شده‌اند. تعامل این زیرواحد‌ها پدیده‌ای مهم برای عملکرد مناسب پروتئین‌ها است. می‌انکنش اسیدهای آمینه بین زنجیره‌های پپتیدی تاثیر قابل توجهی در شکل و پایداری ساختار چهارم پروتئین‌ها دارد. بنابراین، شناسایی این اسیدهای آمینه به زیست‌شناسان کمک می‌کند تا از طریق دستکاری آن‌ها ساختار نهایی را بهبود دهند.

دکتر شهریار عرب استاد دانشگاه تربیت گفت: «CFinder» نرم افزاری تحت وب است که به فرآیند شناسایی اسیدهای آمینه­‌ای که در تماس با زیر واحدهای تشکیل دهنده یک کمپلکس پروتئینی نقش دارند کمک می‌کند، کاربران می‌توانند از طریق بارگذاری فایل P. D. B و وارد کردن نام زنجیره مورد نظر، اسیدهای آمینه‌ه­ایی که در ارتباط با زنجیره مشخص ­شده‌اند را به همراه میزان سهم هر کدام در اتصال شناسایی کند.

بنابراین گزارش، این نرم افزار در آزمایشگاه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس تهیه شده است و بصورت رایگان از طریق آدرس http://bioinf.modares.ac.ir/software/cfinder در دسترس عموم است.