پیکر مطهر این شهید بزرگوار پس از تشییع در میان اقشار مختلف مردمی برای خاکسپاری به سمت گلزار شهدای تهران انتقال می‌یابد. پس از اتمام مراسم تشییع و اقامه نماز بر پیکر شهید موسوی، پیکر مطهرش تا ساعتی دیگر در قطعه 26 در جوار دیگر شهدای مدافع حرم و همرزمانش به خاک سپرده می‌شود.
شهید سید مصطفی موسوی به همراه سه تن دیگر از مدافعان حرم حضرت زینب(س) شامگاه پنجشنبه 21 آبان‌ماه در شهر حلب سوریه به شهادت رسیدند و جمعه 22 آبان‌ماه پیکر مطهرشان به کشور بازگشت.